Более 6 лет назад я, проучившись в универе, ушла в академический отпуск. Но,институт реорганизовали, можно ли по справке об академе поступить в иной вуз или на общих основаниях? Предстоит ли мне сдавать ЕГЭ?

Слишком длительный срок прошел с момента взятия академа, тем более, что ВУЗ реорганизовали. При условии, что ранее вами был сдан ЕГЭ, повторно это делать не нужно.